Zmiana domyślnej ścieżki instalowanych aplikacji...

Nie ma złotego środka.
Primo musiałbyś przenieść wszystko z domyślnej lokalizacji.
Secundo i tak pozostają wpisy w rejestrze dla konkretnych zainstalowanych już aplikacji więc mogą się nie uruchamiać.
Tertio przewałkowanie całego rejestru mając nawet do tego super hiper skrypt/program nie wyeliminuje tego typu błędów, zresztą sam microsoft nie zaleca takiej zmiany.
Quatro, moduły systemowe takie jak np Windows Media Player mają na stałe zaszytą ścieżkę i będzie się wywalać.
Na Twoim miejscu rozszerzyłbym tylko partycję systemową. Panel sterowania -> Narzędzia administracyjne -> Zarządzanie komputerem -> Zarządzanie dyskami. Jak to zrobić masz pełno opisów w sieci jak i tu na forum. No i oczywiście kontrola tego co już jest i ewentualne usunięcie a nie bezmyślne instalowanie co popadnie.