Jak zmienić litere partycji?

Nie odróżniasz pojęcia dysku od partycji.
Poza tym polecenie subst kojarzy dysk wirtualny z ścieżką dostępu do danych na określonej partycji (jednej z wielu na dysku)
Czyli de facto nie możesz zrobić tego polecenia bo jest to tylko mapowanie. Coś jak skrót na pulpicie tylko zamiast skrótu jest wirtualny napęd.
W zarządzaniu dyskami (narzędzia administracyjne) zmień sobie literę dla partycji systemowej i od razu za pomocą narzędzia do edycji rozruchu np BCEdit zmień faktyczną ścieżkę do systemu. Potem możesz zwolnioną literę C przypisać do innej partycji jaką potrzebujesz.