Bootloader nie wykrywa Windows 7 po usunięciu WinXP z poziomu Ubuntu

Narobiłeś chaosu w tej wypowiedzi, z tego mogę wywnioskować, że:
1. Po uruchomieniu komputera uruchamia Ci się GRUB, czyli boot loader linuksowy.
2. Boot loader jest zainstalowany na MBR dysku pierwszym, a na dysku drugim jest/był zainstalowany Windows XP.
3. Windows 7 zainstalowałeś na dysku drugim, wynikiem czego w MBR tego drugiego dysku zainstalował się boot loader windowsowy.
4. GRUB wykrył, że dysk drugi został sformatowany, wynikiem czego usunął wpis o systemie operacyjnym, który był na tym dysku zainstalowany.

Tak więc kilka faktów po Twoich dokonaniach:
1. GRUB sam z siebie nie wykryje zainstalowanego Windows 7, chyba, że wejdziesz do jego konfiguracji w linuksie i dodasz odpowiednią linijkę, jako że to nie jest forum o linuksie to polecam lekturę googla na ten temat. Czekaj! Wyręczyłem Cię! Całą odpowiedź masz tutaj:
http://www.linuxquestions.org/questions/...ub-577176/
2. Oczywiście, że Windows nie wykryje partycji, gdyż po formacie dysku z poziomu linuksa nie ma prawa być takiej partycji jak NTFS, może być co najwyżej FAT32, ale sądzę, że w Ubuntu coś na klikałeś a Ubuntu sformatował Ci partycję do domyślnej, czyli EXT3. Więc w celu instalacji Windows'a na tym dysku musisz tą partycję za pomocą instalatora Windows (czyli płyty do instalacji Windows) usunąć, a następnie sformatować ją do NTFS albo FAT32 - wedle upodobania.
3. Możesz zamienić te dyski fizycznie w komputerze, czyli po prostu przełączyć kabelki i wtedy Windows będzie zawsze uruchamiał się, lecz nie będzie widocznego linuksa. Wtedy możesz po prostu możesz przeinstalować Ubuntu i będzie dokonany upgrade GRUB'a, a wszystko wróci do swojej starej postaci i będziesz miał do wyboru Windowsa lub Ubuntu przy włączeniu komputera.

Kierując się tymi faktami w ten sposób możesz to naprawić, nie radzę stosować różnych programów z dwóch różnych systemów operacyjnych, szczególnie że Twój komputer ma Dual Boot.

P.S. nie polecam bawić się właściwościami partycji NTFS za pomocą linuksa, bo można ją uszkodzić.