Problem z uruchomieniem programów, wyłączeniem komputera - Windows 7 x64

Witam, po problemach z aktualizacją doszły inne problemy. Od kilku-kilkunastu dni mam spore problemy z komputerem- nie da się uruchomić programów, jak się da to się zawieszają, nie mogę przeczyścić rejestru CCleanerem bo też się zawiesza, nawet przeskanować systemu antywirusem a dziś doszło do tego że nawet nie mogę go wyłączyć, ponieważ cały czas trwa wylogowanie i muszę go resetować. Do tego nie mogę nawet odinstalować czy zainstalować żadnego programu. Wczoraj zdążyłem jeszcze jak trochę działo przeskanować Spybotem i znalazł on trojana, którego przeniósł do kwarantanny a jak go stamtąd usunąłem. Dodam że posiadam antywirusa, a regularnie skanuję komputer Malwarebytes i żaden z tych programów nic nie wyłapał, dopiero Spybot. Czy ktoś ma pomysł co z tymi problemami można zrobić ? Przeglądarka od dziwo działa.
Po uruchomieniu w trybie awaryjnym udało mi się wyczyścić rejestr oraz przeskanować Spybotem który nie znalazł żadnego wirusa lub trojana. Odinstalowałem również Deamon tools i uruchomiłem system w trybie normalnym. System normalnie się zamyka, jednak niektóre programy nadal nie reagują i się zawieszają.