GPT na MBR

Opcja jest taka, że pen drive zapewne jest bootowalny jako pierwszy i ustawiłeś to w Biosie, lub Boot menu.
Sprawdź czy Twój "USB boot" jest jako UEFI. Jeżeli tak, to ustaw bootowalne urządzenie jako normalnie bez UEFI i wystartuj Pen'a, to instalator powinien odpalić się w trybie zarządzającym dysk wraz z sektorem rozruchowym MBR.
Jeżeli nadal traktuje go tylko jako GPT, to należy sprawdzić ustawienia Bios, czy tryb UEFI(efi) nie jest wymuszony.