Rozwiązany Autostart nie działa - konto w domenie, bez uprawnień admina.

Zależne jest od tego jak są ustawione polityki zabezpieczeń w GPO dla domeny. Samo nadanie lokalnych praw administracyjnych nie musi rozwiązywać problemu.
Ostatnio dodawałem do autostartu na koncie domenowym (lokalnie) w pierwszym folderze o którym wspomniałeś. Nie znam polityki zabezpieczeń niemniej po wklepaniu poświadczeń administratora domeny aplikacja uruchamia się bezproblemowo.
W swojej sprawie popytaj się na http://wss.geekclub.pl/forum

W części pracowni mogą być pozakładane sprzętowe karty przywracania, które doprowadzają partycje do stanu sprzed sesji na podstawie rejestrowanych zmian.